Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELLSQ9NRZ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms