Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHPT1Q9NRX4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHPT1Q9NRX4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms