Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB6BQ9NRW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms