Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF3Q9NR81 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms