Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2CQ9NQX7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITM2CQ9NQX7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms