Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAC1Q9NQ79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms