Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD93Q9NPY3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms