Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC4Q9NPG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC4Q9NPG8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZDHHC4Q9NPG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms