Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC4Q9NPD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC4Q9NPD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC4Q9NPD3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC4Q9NPD3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC4Q9NPD3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms