Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms