Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms