Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms