Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CWC22Q9HCG8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CWC22Q9HCG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC22Q9HCG8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms