Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELL3Q9HB65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELL3Q9HB65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms