Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHEJ1Q9H9Q4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms