Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSS3Q9H6R3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms