Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RETREG1Q9H6L5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RETREG1Q9H6L5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms