Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf49Q9H6J7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C11orf49Q9H6J7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms