Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MFSD1Q9H3U5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms