Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX1Q9H3N1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX1Q9H3N1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX1Q9H3N1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms