Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms