Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms