Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIL1Q9H173 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIL1Q9H173 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms