Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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