Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms