Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms