Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1EQ9GZS1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms