Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms