Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCGF6Q9BYE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms