Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAPERQ9BY12 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAPERQ9BY12 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms