Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms