Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM14BQ9BX40 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms