Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7Q9BWT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7Q9BWT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7Q9BWT1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDCA7Q9BWT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms