Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP4Q9BWG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms