Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms