Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP58Q9BVL2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms