Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PBDC1Q9BVG4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms