Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms