Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCMBPQ9BTE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms