Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms