Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP2Q9BSJ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms