Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FYCO1Q9BQS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FYCO1Q9BQS8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms