Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSG101Q99816 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms