Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POP1Q99575 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP1Q99575 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP1Q99575 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP1Q99575 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POP1Q99575 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP1Q99575 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP1Q99575 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP1Q99575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms