Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT12Q99456 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms