Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms