Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAPLN3Q96S86 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms