Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CICQ96RK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms