Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACCSQ96QU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACCSQ96QU6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms