Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms